Nachdem ich nochmals Version 2.4 probierte, jegliche BIOS Einstellungen änderte und das System über einen Tag laufen ließ, bekam ich die Fehler wieder - mehrmals pro Tag, meist bei den stündlichen crons.
Ich habe die Firewall nun mal auf Version 2.4.1 geupdatet. Die Probleme sind verschwunden DIe Firewall läuft nun durch, ohne angebliche HDD Timeouts oder ähnliches.
Das Problem liegt wohl wirklich an der alten Version, dem Kernel, der Software, was weiß der Geier - nun geht alles wunderbar
Danke an Euch beide.